Fundacja Polska–Japonia oficjalnie została członkiem European Association for Japanese Studies (EAJS), prestiżowej międzynarodowej strukturze poświęconej rozwijaniu badań nad Japonią. Założona w 1973 roku, EAJS zrzesza naukowców, badaczy i studentów zajmujących się japonistyką w ramach nauk humanistycznych i społecznych. Jej misją jest promowanie wysokiej jakości badań dotyczących Japonii. Dzięki członkostwu Fundacja Polska–Japonia dołącza do dynamicznej społeczności wspierającej międzynarodową współpracę oraz wymianę akademicką. Nowa afiliacja wzmacnia zaangażowanie Fundacji w rozwój japonistyki oraz pogłębianie współpracy między Polską, Japonią i szerszą globalną społecznością akademicką.

Fundacja Polska-Japonia (FPJ) działa na rzecz współpracy i rozwoju wzajemnych relacji pomiędzy podmiotami i mieszkańcami z obydwu krajów.